โรงเรียนหนองจอกกงลิบฮัวเคียว ก่อตั้งเมื่อ พ.ศ. 2460 โดยนายเป็งเซิง แซ่เตีย นายเกี้ยมง้วน แซ่ผู่ นางกวงเซียง แซ่ลิ้ม ชาวจีนอพยพและชาวหนองจอกส่วนหนึ่ง ได้เห็นคุณค่าของการจัดการศึกษาแก่เยาวชนคนรุ่นใหม่ และเป็นการเปิดโอกาสให้ลูกหลานชาวบ้านในท้องถิ่นที่ชนบทห่างไกลและยากจนได้มีโอกาสได้รับการศึกษา ที่สอดคล้องกับอุดมการณ์ในการจัดการศึกษาของชาติและการสอนภาษาจีนเป็นการดำรงไว้ซึ่งขนบธรรมเนียม วัฒนธรรมและประเพณีของบรรพบุรุษ
จึงได้ร่วมกันก่อสร้างอาคารเรียนเป็นอาคารไม้ 2 ชั้นมีชื่อเรียกกันว่า "โรงเรียนจีน" (โรงเรียนจีนของชาวจีนโพ้นทะเล)เปิดทำการเรียนการสอนตามแผนการศึกษาของประเทศไทยและสอนภาษาจีนจนถึงปี 2480 เกิดการเปลี่ยนแปลงทางการเมืองและการปกครองในประเทศไทย ซึ่งรัฐบาลไทยขณะนั้นยังไม่ได้เจริญสัมพันธไมตรีกับประเทศจีน (สาธารณรัฐประชาธิปไตยประชาชนจีน)หรือที่เรียนกันว่าจีนแผ่นดินใหญ่ ซึ่งมีการปกครองแบบสังคมนิยมคอมมิวนิสต์จึงถูกสั่งให้ปิดทำการเรียนการสอนต่อเนื่องมาเป็นเวลา 10 ปี

ต่อมาเหตุการณ์ทางการเมืองคลี่คลายขึ้น ทางโรงเรียนจึงได้เปิดทำการเรียนการสอนอีกครั้งหนึ่งใน
วันที่ 14 กรกฏาคม 2490 และพัฒนาเรื่อยมาจนถึงปัจจุบัน ในปี 2529 ได้มีการเปลี่ยนแปลงเกี่ยวกับอาคารเรียน โดยคณะกรรมการซึ่งมีการจดทะเบียนเป็นมูลนิธิโรงเรียนหนองจอกกงลิบฮัวเคียว ได้สร้างอาคารเรียนชั้นใหม่ เป็นอาคารปูนซีเมนต์แบบคอนกรีตเสริมเหล็ก มี 4 ชั้นใต้ถุนโล่งและในปี2535 ได้ทำการต่อเติมชั้นล่างให้เป็นห้องเรียนสำหรับนักเรียนอนุบาล ในปี 2545 ได้รื้อบ้านพักครูที่อยู่ด้านทิศตะวันตก ออกแล้วสร้างอาคารเรียนอีก 1 หลังเป็นอาคารคอนกรีตเสริมเหล็ก 4 ชั้นมีทางเชื่อมต่อกับอาคารเรียนหลังแรกทุกชั้น ทำให้มีห้องเรียน ห้องพักครู และห้องปฏิบัติการเรียนการสอนต่างๆสะดวกและครบถ้วนเพียงพอต่อความต้องการ

โรงเรียนหนองจอกกงลิบฮัวเคียวตั้งอยู่บริเวณหลังตลาดหนองจอก บริเวณที่บรรจบของคลองหลายสาย ได้แก่ คลองสิบสอง คลองสิบสาม คลองสิบสี่

คลองแสนแสบและคลองลำปลาทิว ลักษณะชุมชนเป็นชุมชนแออัดเป็นศูนย์กลางการค้า พานิชยกรรมและการคมนาคมขนส่ง ประชากรส่วนใหญ่ประกอบอาชีพรับจ้าง ทำนา ทำสวน ค้าขาย และลูกจ้างโรงงานอุตสาหกรรม ส่วนใหญ่นับถือศาสนาอิสลามและศาสนาพุทธ โดยทางโรงเรียนมีนักเรียนที่นับถือศาสนาพุทธมากกว่าศาสนาอิสลาม